ごくごく普通の現代日本。 少しだけ変わっているのは――。 この世界には「神さま」がいる。 ある日、中学3年生の陽美谷ナギに届いたのは「神さま学校・惟神學園」の合格通知。 強い「神通力」を持つエリートばかりが通うこの学校で、ごく普通の学生として生きてきたナギは自身の「神通力」すらわからず、早々に「落ちこぼれ」の烙印を押されてしまう。 だが、高位の「神さま」である月読命はナギに特別な何かを感じているようで…… 「落ちこぼれ」に秘められた力。徐々に明らかになる過去と未来が、隠され続けた真実を解き明かす。
